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作者：韓穎 高欣玥 （編譯） 新型冠狀病毒引起的肺炎，於2019年12月下旬在武漢流行，並在中國迅速傳播。截至2020年3月4日，中國共確診80424例新冠病例，有2984人死亡。更為嚴峻的是，在中國之外的46個國家和地區，已有超過4000例確診病例。新冠肺炎防治仍然處於關鍵階段。 新冠病毒如何進化？是否已經發生突變？是目前學界研究的焦點之一。2020年3月3日，中國科學院主辦的《國家科學評論》（National Science Review）發表的論文《關於SARS-CoV-2的起源和持續進化》（On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）對以上問題進行了解答。 論文通訊作者為陸劍研究員（北京大學生命科學學院生物信息中心）、崔傑研究員（中國科學院上海巴斯德研究所）。 論文對目前為止最大規模的103個新冠病毒全基因組分子進化分析，得出很多重要結論。 1.新冠病毒毒株已發現149個突變點 基於對103個測序菌株的DNA測序結果，最先發現的突變中，發現43個同義突變，83個非同義突變。 ... 多數突變為同義突變的單例（67.4％（29/43））和84.3％（70/83）非同義突變），作者認為這顯示最近的突變起源還是種群增長。 在103個測序菌株中，科學家共發現149個突變位點。 2.新冠病毒被分為S型和L型 ...研究人員表示，目前並沒有發現病毒菌株之間基因重組的證據，但是研究人員發現納入研究的103株菌株中有101株在位置8,782和28,144處的核苷酸顯示出明顯的連鎖關係，72個菌株表現出「 CT」單倍型（定義為「 L」型，因為T28,144位於亮氨酸的密碼子中），29個菌株表現出「 TC」單倍型（定義為「 S」型，因為C28,144位於絲氨酸的密碼子中）。占比上看，L亞型更為普遍達到70%，S亞型占30%。通過與其他冠狀病毒比較，作者發現S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近，從而得出S型相對更古老的結論。... 3.新冠病毒亞型具有地域、時間差異性 為測試兩種類型的新冠病毒在時間和空間上是否存在差異分布，研究者根據分離的位置和日期對病毒進行分層。 ... SARS-CoV-2病毒的單倍型分析（註：藍色代表L型，紅色代表S型。橙色箭頭表示L型是從S型演變而來的。研究者用病毒採集地理位置和隔離病毒的日期。） 從武漢分離出的27種病毒中，有26種（96.3％）是L型，只有1種（3.7％）為S型。但是，在武漢以外的其他73種病毒中，有45種（61.6％）L型為S型，其中28種（38.4％）為S型。比較表明，武漢地區L型新冠肺炎的流行率明顯高於其他地方（P = 0.0004）。 ... 此外，研究人員還發現2020年1月7日之前分離出的26個樣本全部來自武漢，2020年1月7日開始收集的74個樣本中，只有一個來自武漢，有33個來自中國其他地方，40個來自中國以外的毒株。L型在2020年1月7日之前更普遍（96.2％，25 L和1 S）比2020年1月7日之後的（62.2％，46 L和28 S）（P = 0.0008）。 研究者還表示，L型比S型更具攻擊性，但L型毒株在武漢初次爆發後有所減少，這可能和2020年1月以來，中國中央和地方政府採取了迅速全面的預防和控制措施。這些人為干預措施可能會對L型造成嚴重的選擇性壓力，使得L型毒株更具侵略性。而S類型可能具有受到人為干預的選擇性壓力較弱。目前尚不清楚L型在進化過程中是如何從S型演化而來的。 4.除了S型和L型，可能存在其他突變型 這103個樣本顯示，大部分患者只感染了L亞型或S亞型中的一個。不過，1月21日從一名有過武漢旅行史的美國患者（USA_2020 / 01 / 21.a，GISAID ID：EPI_ISL_404253）分離出的病毒株，在兩個位置8,782和28,144的基因型均為Y（C或T），顯示其可能同時感染了L型和S型新冠病毒。 但目前尚不清楚該患者所感染的L型和S型病毒是否由多次感染所致，經搜索新型冠狀病毒基因組庫後，尚無其他患者同時感染L型和S型病毒證據。作者表示目前還無法排除新突變型的可能性。 結語： 研究者表示，在這項研究中，數據仍然非常有限，目前研究結果顯示新型冠狀病毒進化過程日趨複雜，新型冠狀病毒不同等位基因競爭機制的需要進一步進行研究。但對不同亞型的深入了解，將有助於新冠肺炎的差異化治療和防控。 參考文獻： Xiaolu Tang , Changcheng Wu , Xiang Li , Yuhe Song , Xinmin Yao, et al. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2 ；https://academic.oup.com/nsr/advance-article-abstract/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463 by guest on 04 March 2020 本文轉載自其他網站，不代表健康界觀點和立場。如有內容和圖片的著作權異議，請及時聯繫我們（郵箱：guikequan@hmkx.cn）

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